Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NKX2-2
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| NKX2-2, NKX2.2, NKX2B, NK2 homeobox 2 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 604612 MGI: 97347 HomoloGene: 1879 GeneCards: NKX2-2
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• positive regulation of oligodendrocyte differentiation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • pancreatic PP cell fate commitment • GO:1904578 response to organic cyclic compound • розвиток клітин • spinal cord oligodendrocyte cell fate specification • response to progesterone • neuron fate specification • response to glucose • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • brain development • astrocyte differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of neuron differentiation • positive regulation of cell differentiation • регуляція диференціювання клітин • smoothened signaling pathway • oligodendrocyte development • spinal cord motor neuron differentiation • digestive tract development • pancreatic A cell fate commitment • type B pancreatic cell fate commitment • ventral spinal cord interneuron fate determination • type B pancreatic cell development • spinal cord oligodendrocyte cell differentiation • optic nerve development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • endocrine pancreas development
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 20: 21.51 – 21.51 Mb
| Хр. 2: 147.18 – 147.19 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
NKX2-2 (англ. NK2 homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 133[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSLTNTKTGF | | SVKDILDLPD | | TNDEEGSVAE | | GPEEENEGPE | | PAKRAGPLGQ |
GALDAVQSLP | | LKNPFYDSSD | | NPYTRWLAST | | EGLQYSLHGL | | AAGAPPQDSS |
SKSPEPSADE | | SPDNDKETPG | | GGGDAGKKRK | | RRVLFSKAQT | | YELERRFRQQ |
RYLSAPEREH | | LASLIRLTPT | | QVKIWFQNHR | | YKMKRARAEK | | GMEVTPLPSP |
RRVAVPVLVR | | DGKPCHALKA | | QDLAAATFQA | | GIPFSAYSAQ | | SLQHMQYNAQ |
YSSASTPQYP | | TAHPLVQAQQ | | WTW |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|